自此后，叶赫那拉氏成为当时东北最大的一支部落。但是，到了明末，叶赫那拉氏与爱新觉罗之间再度爆发了大战，这次大战就是努尔哈赤领导的。在这次的大战中，叶赫那拉族不敌努尔哈赤的强兵锐将，败给了爱新觉罗的建州女真，从此草原上的形势骤变，草原的主人不再是叶赫族人了，就连日后入主中原的天子都变成了爱新觉罗氏。从此建州女真与叶赫结下不共戴天之仇。

但是这种仇恨并没有演化到我们所认知的那种地步，现在我们知道慈禧太后和隆裕皇后都是叶赫族人，而且太祖努尔哈赤也曾娶过叶赫的皇后。清太祖努尔哈赤的孝慈高皇后叶赫那拉氏是叶赫部贝勒扬佳努的爱女，称孟古格格，14岁的时候嫁给了努尔哈赤。她是一个非常贤淑聪敏的姑娘，深得努尔哈赤的喜爱。只可惜的是，她在29岁的时候就撒手人寰。

从这里我们就可以看出来，所谓成也叶赫败也叶赫的说法是根本没有依据的。努尔哈赤是清朝的开国明君，而且他娶叶赫人的时候正是双方交战的时候，如果真的有所谓的成也叶赫败也叶赫的说法的话，努尔哈赤怎么会轻易地就娶了叶赫族人呢？至于清朝确实毁于慈禧手里的事实，只是一个巧合而已。